第二天早上，考古人员也被吸入其中，这时的耿鬼准备下山，小智由于害怕山下的真新镇遭到毁灭而奋力的反击，此时房间里的金色之眼和金色的勺子也都起了反应，两件器物合为一体。
这时从旁边另一个岩壁上出现了一个遗迹，巨大的胡地也从里面出现了，两只巨大的古代宝可梦开始争斗，原来古代的时候，就是这两只宝可梦毁灭了古代宝可梦文明。
这时，胖丁赶到，本以为靠胖丁的歌声可以成功催眠两只巨大宝可梦，但是还是没成功，不过它的歌声引起了铜器的反应，从里面出来了一只巨大的胖丁，它的歌声成功地使巨大宝可梦们都沉睡了，小智他们也不例外，当他们醒来时，巨大的宝可梦们都消失了，原来它们变成了圆球回到了地底，根据怀特所说，这个结晶很可能就是精灵球的起源。
传说中的宝可梦文明是一个发生了天灾地祸而一夜之间消失的都市，他们将宝可梦们当做超自然的力量，加以崇拜，而这座山上发现的物件证实了这个传说。
这里还有关于这个传说的记录，在遗迹里有一块石板上写着宝可梦的文字：
毁灭世界的两股力量
黑色的黑暗，染黑了天空
金色的眼眸，扰乱了气
把世界一分为二的争端
人们束手无策
异界之门在天空打开
此时出现了平息一切的力量
化成圆球回到地平线以下
当然，翔太是不可能把原本他所熟知的剧情告诉娜姿，只是和她讲了一个大概。
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